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Teenage Mutant Ninja Turtles IV: Turtles in Time

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游戏的开场过场动画概述了游戏的剧情。故事始于忍者神龟们收看周日晚间的电视新闻，爱普莉·奥尼尔正在自由岛进行报道。突然，克朗驾驶着一套巨大的外骨骼装甲（在动画系列中偶尔出现）飞入画面，偷走了自由女神像，紧接着施莱德劫持了电视信号，嘲笑忍者神龟们。 忍者神龟们迅速行动，在纽约市中心展开追击，一路追着脚帮穿过街道和城市下水道（在SFC版本中则追到科技龙基地），在那里施莱德将他们送入时空扭曲。忍者神龟们必须在过去和未来两个时代中对抗施莱德的军队，才能回到家园。他们与施莱德战斗，直到他坠落身亡，而自由女神像也被放回了原位。